Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2r2Q6ZWZ2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms