Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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Cnih3Q6ZWS4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Cnih3Q6ZWS4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Cnih3Q6ZWS4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnih3Q6ZWS4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Cnih3Q6ZWS4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnih3Q6ZWS4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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