Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RfflQ6ZQM0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms