Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ncapd3Q6ZQK0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ncapd3Q6ZQK0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms