Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp8b3Q6UQ17 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp8b3Q6UQ17 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp8b3Q6UQ17 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp8b3Q6UQ17 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp8b3Q6UQ17 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp8b3Q6UQ17 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp8b3Q6UQ17 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp8b3Q6UQ17 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp8b3Q6UQ17 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp8b3Q6UQ17 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp8b3Q6UQ17 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp8b3Q6UQ17 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp8b3Q6UQ17 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp8b3Q6UQ17 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp8b3Q6UQ17 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp8b3Q6UQ17 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp8b3Q6UQ17 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp8b3Q6UQ17 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp8b3Q6UQ17 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp8b3Q6UQ17 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp8b3Q6UQ17 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp8b3Q6UQ17 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp8b3Q6UQ17 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Atp8b3Q6UQ17 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Atp8b3Q6UQ17 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Atp8b3Q6UQ17 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp8b3Q6UQ17 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp8b3Q6UQ17 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Atp8b3Q6UQ17 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Atp8b3Q6UQ17 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Atp8b3Q6UQ17 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Atp8b3Q6UQ17 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Atp8b3Q6UQ17 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Atp8b3Q6UQ17 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Atp8b3Q6UQ17 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Atp8b3Q6UQ17 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Atp8b3Q6UQ17 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp8b3Q6UQ17 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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