Protein–RNA interactions for Protein: Q6UJY2

Slc9c1, Sodium/hydrogen exchanger 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9c1Q6UJY2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc9c1Q6UJY2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc9c1Q6UJY2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc9c1Q6UJY2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc9c1Q6UJY2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc9c1Q6UJY2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc9c1Q6UJY2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9c1Q6UJY2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9c1Q6UJY2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9c1Q6UJY2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9c1Q6UJY2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9c1Q6UJY2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9c1Q6UJY2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9c1Q6UJY2 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9c1Q6UJY2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9c1Q6UJY2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9c1Q6UJY2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms