Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFY8

Trim45, Tripartite motif-containing protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim45Q6PFY8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim45Q6PFY8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim45Q6PFY8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim45Q6PFY8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim45Q6PFY8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim45Q6PFY8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim45Q6PFY8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim45Q6PFY8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim45Q6PFY8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim45Q6PFY8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim45Q6PFY8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim45Q6PFY8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim45Q6PFY8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim45Q6PFY8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim45Q6PFY8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim45Q6PFY8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim45Q6PFY8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim45Q6PFY8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim45Q6PFY8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim45Q6PFY8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim45Q6PFY8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim45Q6PFY8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms