Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gapvd1Q6PAR5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gapvd1Q6PAR5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gapvd1Q6PAR5 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gapvd1Q6PAR5 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gapvd1Q6PAR5 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gapvd1Q6PAR5 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gapvd1Q6PAR5 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gapvd1Q6PAR5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gapvd1Q6PAR5 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gapvd1Q6PAR5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gapvd1Q6PAR5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gapvd1Q6PAR5 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gapvd1Q6PAR5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gapvd1Q6PAR5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gapvd1Q6PAR5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms