Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9Q4

Fhod1, FH1/FH2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhod1Q6P9Q4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fhod1Q6P9Q4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 170.4 ms