Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rrp12Q6P5B0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms