Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L7

Casc4, Protein CASC4, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc4Q6P2L7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Casc4Q6P2L7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms