Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2B1

Tnpo3, Transportin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo3Q6P2B1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnpo3Q6P2B1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms