Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXL5

Acap3, ArfGAP with coiled-coil, ankyrin repeat and PH domains 3, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acap3Q6NXL5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Acap3Q6NXL5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms