Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rprd2Q6NXI6 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rprd2Q6NXI6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms