Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpbp1Q6NXH3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms