Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Atg16l2Q6KAU8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg16l2Q6KAU8 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms