Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tpm4Q6IRU2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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