Protein–RNA interactions for Protein: Q6GSS7

Hist2h2aa1, Histone H2A type 2-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hist2h2aa1Q6GSS7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms