Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pram1Q6BCL1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pram1Q6BCL1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pram1Q6BCL1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pram1Q6BCL1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pram1Q6BCL1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pram1Q6BCL1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pram1Q6BCL1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pram1Q6BCL1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pram1Q6BCL1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pram1Q6BCL1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Pram1Q6BCL1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pram1Q6BCL1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pram1Q6BCL1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pram1Q6BCL1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pram1Q6BCL1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pram1Q6BCL1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pram1Q6BCL1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Pram1Q6BCL1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms