Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CilpQ66K08 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CilpQ66K08 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms