Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc8eQ66JT1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.3 ms