Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Knl1Q66JQ7 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms