Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnna3Q65CL1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnna3Q65CL1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms