Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VclQ64727 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VclQ64727 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VclQ64727 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VclQ64727 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VclQ64727 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VclQ64727 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VclQ64727 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VclQ64727 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VclQ64727 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VclQ64727 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VclQ64727 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VclQ64727 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VclQ64727 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VclQ64727 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VclQ64727 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VclQ64727 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VclQ64727 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VclQ64727 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VclQ64727 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VclQ64727 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VclQ64727 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VclQ64727 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VclQ64727 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VclQ64727 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VclQ64727 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VclQ64727 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VclQ64727 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VclQ64727 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VclQ64727 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VclQ64727 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VclQ64727 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VclQ64727 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VclQ64727 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VclQ64727 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VclQ64727 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VclQ64727 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VclQ64727 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VclQ64727 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VclQ64727 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VclQ64727 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VclQ64727 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VclQ64727 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VclQ64727 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VclQ64727 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VclQ64727 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VclQ64727 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
VclQ64727 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VclQ64727 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VclQ64727 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VclQ64727 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VclQ64727 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VclQ64727 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VclQ64727 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VclQ64727 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VclQ64727 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VclQ64727 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
VclQ64727 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VclQ64727 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
VclQ64727 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
VclQ64727 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VclQ64727 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VclQ64727 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
VclQ64727 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VclQ64727 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VclQ64727 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VclQ64727 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VclQ64727 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VclQ64727 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VclQ64727 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VclQ64727 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VclQ64727 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VclQ64727 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VclQ64727 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
VclQ64727 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
VclQ64727 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
VclQ64727 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VclQ64727 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VclQ64727 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VclQ64727 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VclQ64727 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VclQ64727 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VclQ64727 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VclQ64727 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VclQ64727 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VclQ64727 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VclQ64727 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VclQ64727 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VclQ64727 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VclQ64727 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VclQ64727 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VclQ64727 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VclQ64727 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VclQ64727 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VclQ64727 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VclQ64727 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VclQ64727 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VclQ64727 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VclQ64727 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VclQ64727 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms