Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc3Q64519 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Sdc3Q64519 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Sdc3Q64519 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Sdc3Q64519 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdc3Q64519 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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