Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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PtprdQ64487 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprdQ64487 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprdQ64487 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprdQ64487 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprdQ64487 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprdQ64487 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprdQ64487 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprdQ64487 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprdQ64487 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprdQ64487 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprdQ64487 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprdQ64487 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprdQ64487 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprdQ64487 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprdQ64487 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprdQ64487 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprdQ64487 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprdQ64487 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprdQ64487 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprdQ64487 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprdQ64487 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprdQ64487 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprdQ64487 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprdQ64487 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprdQ64487 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprdQ64487 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprdQ64487 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprdQ64487 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprdQ64487 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprdQ64487 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprdQ64487 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprdQ64487 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprdQ64487 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprdQ64487 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprdQ64487 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprdQ64487 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprdQ64487 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprdQ64487 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprdQ64487 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprdQ64487 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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PtprdQ64487 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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PtprdQ64487 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprdQ64487 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprdQ64487 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprdQ64487 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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PtprdQ64487 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprdQ64487 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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PtprdQ64487 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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PtprdQ64487 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprdQ64487 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprdQ64487 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprdQ64487 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprdQ64487 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprdQ64487 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprdQ64487 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
PtprdQ64487 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
PtprdQ64487 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprdQ64487 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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