Protein–RNA interactions for Protein: Q64446

Atp7b, Copper-transporting ATPase 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp7bQ64446 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Atp7bQ64446 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atp7bQ64446 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atp7bQ64446 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp7bQ64446 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms