Protein–RNA interactions for Protein: Q64253

Ly6e, Lymphocyte antigen 6E, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6eQ64253 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ly6eQ64253 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms