Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc18Q640L5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc18Q640L5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
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