Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itga3Q62470 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms