Protein–RNA interactions for Protein: Q62458

Gm20809, (clone BALB14N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20809Q62458 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20809Q62458 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms