Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Vamp1Q62442 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Vamp1Q62442 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Vamp1Q62442 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Vamp1Q62442 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Vamp1Q62442 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Vamp1Q62442 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Vamp1Q62442 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Vamp1Q62442 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Vamp1Q62442 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vamp1Q62442 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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