Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

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Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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AtmQ62388 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtmQ62388 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtmQ62388 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtmQ62388 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AtmQ62388 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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AtmQ62388 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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AtmQ62388 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AtmQ62388 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AtmQ62388 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AtmQ62388 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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AtmQ62388 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AtmQ62388 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AtmQ62388 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AtmQ62388 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AtmQ62388 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AtmQ62388 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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AtmQ62388 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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AtmQ62388 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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AtmQ62388 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AtmQ62388 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AtmQ62388 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AtmQ62388 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AtmQ62388 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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AtmQ62388 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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AtmQ62388 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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AtmQ62388 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15□□□□□ -0.01
AtmQ62388 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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AtmQ62388 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
AtmQ62388 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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AtmQ62388 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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