Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Ss18Q62280 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Ss18Q62280 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Ss18Q62280 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Ss18Q62280 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Ss18Q62280 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Ss18Q62280 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Ss18Q62280 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Ss18Q62280 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ss18Q62280 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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