Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SypQ62277 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SypQ62277 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SypQ62277 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SypQ62277 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SypQ62277 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SypQ62277 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SypQ62277 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SypQ62277 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SypQ62277 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SypQ62277 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SypQ62277 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SypQ62277 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SypQ62277 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SypQ62277 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SypQ62277 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SypQ62277 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SypQ62277 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SypQ62277 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SypQ62277 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SypQ62277 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SypQ62277 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SypQ62277 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SypQ62277 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SypQ62277 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SypQ62277 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SypQ62277 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SypQ62277 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SypQ62277 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SypQ62277 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SypQ62277 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SypQ62277 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SypQ62277 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SypQ62277 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SypQ62277 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SypQ62277 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SypQ62277 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SypQ62277 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SypQ62277 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SypQ62277 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SypQ62277 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SypQ62277 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SypQ62277 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SypQ62277 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SypQ62277 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SypQ62277 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SypQ62277 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SypQ62277 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SypQ62277 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SypQ62277 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SypQ62277 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SypQ62277 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SypQ62277 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SypQ62277 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SypQ62277 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SypQ62277 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SypQ62277 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SypQ62277 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SypQ62277 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SypQ62277 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SypQ62277 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SypQ62277 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SypQ62277 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SypQ62277 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
SypQ62277 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SypQ62277 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SypQ62277 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SypQ62277 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SypQ62277 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SypQ62277 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SypQ62277 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SypQ62277 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SypQ62277 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SypQ62277 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SypQ62277 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SypQ62277 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SypQ62277 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SypQ62277 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SypQ62277 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SypQ62277 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SypQ62277 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SypQ62277 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SypQ62277 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SypQ62277 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SypQ62277 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SypQ62277 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SypQ62277 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SypQ62277 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SypQ62277 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SypQ62277 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SypQ62277 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SypQ62277 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SypQ62277 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SypQ62277 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SypQ62277 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SypQ62277 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SypQ62277 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SypQ62277 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SypQ62277 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SypQ62277 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms