Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sall3Q62255 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms