Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SspnQ62147 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SspnQ62147 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SspnQ62147 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SspnQ62147 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SspnQ62147 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SspnQ62147 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SspnQ62147 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SspnQ62147 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SspnQ62147 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SspnQ62147 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SspnQ62147 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SspnQ62147 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SspnQ62147 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SspnQ62147 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SspnQ62147 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SspnQ62147 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SspnQ62147 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SspnQ62147 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SspnQ62147 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SspnQ62147 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SspnQ62147 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SspnQ62147 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SspnQ62147 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SspnQ62147 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SspnQ62147 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SspnQ62147 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SspnQ62147 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SspnQ62147 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SspnQ62147 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SspnQ62147 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SspnQ62147 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SspnQ62147 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SspnQ62147 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SspnQ62147 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SspnQ62147 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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