Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms