Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga7Q61738 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms