Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna1eQ61290 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna1eQ61290 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna1eQ61290 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna1eQ61290 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna1eQ61290 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna1eQ61290 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna1eQ61290 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna1eQ61290 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna1eQ61290 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna1eQ61290 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna1eQ61290 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna1eQ61290 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna1eQ61290 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna1eQ61290 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cacna1eQ61290 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1eQ61290 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms