Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms