Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Foxd3Q61060 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Foxd3Q61060 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Foxd3Q61060 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Foxd3Q61060 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Foxd3Q61060 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Foxd3Q61060 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Foxd3Q61060 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Foxd3Q61060 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxd3Q61060 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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