Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Klf3Q60980 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms