Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.06■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nr2f1Q60632 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr2f1Q60632 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms