Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms