Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp13a3Q5XF89 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms