Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnfsf15Q5UBV8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms