Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc42Q5SV66 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms