Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSM3

Arhgap44, Rho GTPase-activating protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap44Q5SSM3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arhgap44Q5SSM3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arhgap44Q5SSM3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arhgap44Q5SSM3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arhgap44Q5SSM3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms