Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf215Q5SPX3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf215Q5SPX3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf215Q5SPX3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf215Q5SPX3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf215Q5SPX3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf215Q5SPX3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf215Q5SPX3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf215Q5SPX3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf215Q5SPX3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf215Q5SPX3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf215Q5SPX3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf215Q5SPX3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf215Q5SPX3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf215Q5SPX3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf215Q5SPX3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf215Q5SPX3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf215Q5SPX3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf215Q5SPX3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf215Q5SPX3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf215Q5SPX3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf215Q5SPX3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf215Q5SPX3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf215Q5SPX3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf215Q5SPX3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf215Q5SPX3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf215Q5SPX3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf215Q5SPX3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf215Q5SPX3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf215Q5SPX3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf215Q5SPX3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf215Q5SPX3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf215Q5SPX3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf215Q5SPX3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rnf215Q5SPX3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rnf215Q5SPX3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf215Q5SPX3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms